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第十一集
警察中的内线马卡赞恩给托尼送来一条紧急消息：瑟普拉诺集团中有叛徒，而且更糟糕的是，最大的嫌疑落在托尼最信任的老朋友“大猫”波潘西亚诺的身上。“大猫”在一次警察的突袭中被逮捕，他与吉米-阿提里合开的俱乐部因此破产，被保释之后，经济危机的大猫面对孩子们的学费苦恼不已。这也许就是他背叛老朋友的动机？
托尼派保里去监视波潘西亚诺，他在亲眼看到证据之前决不会轻易走出下一步。与此同时，马卡赞恩在光顾妓院时被捕，遭警局停职后跳河自杀。当托尼苦于无法确认波潘西亚诺的忠诚时，吉米-阿提里进入了他的视线。
“大猫”的嫌疑最终被洗清了，但是波潘西亚诺却失去了踪迹。而另一边，克拉多给托尼送来了一纸合同。
第十二集
自从“大猫”失踪以后，托尼开始陷入前所未有的低潮，他躲开卡梅拉和孩子们，甚至忽视集团的工作，连个人卫生也被弃置脑后。詹妮弗医生尝试用抑郁症药物“百忧解”和锂盐来治疗托尼，但似乎任何努力都不见效。直到托尼看见了伊萨贝拉。
伊萨贝拉是一个美丽的意大利女孩，托尼从窗口看到了她，并无法抑制的立刻出门向她搭话。伊萨贝拉是来进修牙科的交流学习生，当她用甜美的声音娓娓谈起托尼的故国意大利，纠缠他已久的阴霾立刻一扫而光，生活的希望终于又到了托尼的身边。
克拉多终于采取了最后的手段，两个年轻的枪手在街头截住了托尼。但是硝烟过后托尼受伤未死，二个杀手先下了地狱。克拉多和丽维亚为暗杀失败而万分紧张。
但是伊萨贝拉也就此消失了，她只是锂盐带给托尼的美丽幻觉而已。
第十三集
叛徒吉米-阿提里被装进了裹尸袋，身上带着成排的弹孔，嘴里被塞着一只老鼠。瑟普拉诺集团把尸体丢弃一条小巷中，告诫着每一个黑道成员：这就是叛徒的下场。
联邦调查局突然找到了托尼，他们让托尼听了一盘养老院中录下的音带：克拉多和丽维亚的声音在谋划如何干掉托尼。而更糟糕的是，联邦调查局也知道了托尼正在进行心理咨询。托尼立即去警告詹妮弗医生，她必须尽快离开这里，否则会有生命危险。然后托尼把心理治疗的事情告诉了同伙们，所幸得到的反应并不糟糕。现在唯一要做的事情就是让克拉多和丽维亚付出代价了。
但是克拉多先一步被捕，联邦探员给了他一笔不错的交易，只要克拉多能证明托尼才是犯罪集团的头领，他就能得到污点证人的保护措施。丽维亚突然中风瘫痪，但是没有人比托尼更了解自己的母亲了，氧气面罩下丽维亚绽开一个残忍的微笑，她不会就此淡出托尼的生活。
面对即将来临的暴风雨，托尼和卡梅拉带着孩子们在阿蒂-博考的餐厅里举起了酒杯。
十四集：
克拉多因为12项罪名受到指控，托尼-瑟普拉诺因此成为家族的惟一掌权人，他一边掌管着生意，一边尽力避免引起美联储的注意。让他头痛的是，克里斯托弗-摩尔提萨蒂得到了证券交易会颁发的经纪人执业证书，开始对付迈特和肖恩两个人。
上一季中的“大猫” 波潘西亚诺还活着，而且回到了新泽西，他告诉托尼自己一直在波多黎哥治疗背伤，并认识了一位26岁的漂亮女针灸师。
另一方面，丽维亚仍然住在医院里，中风的她不是身体尚未复原就是打算躲开托尼。而他失散已久的姐姐贾妮斯从西雅图来了，称自己只是为母亲着想。尽管离开新泽西后她已经改名叫帕华蒂，但托尼还是向卡梅拉表示，十分怀疑她的真实动机。卡梅拉想让他继续接受心理治疗，但是詹妮弗医生不让托尼靠近，也不把他介绍给别人。
第十五集：
波潘西亚诺去诊所时在候诊室遇到了FBI特工斯基普，他们开车回家的路上观众才得知，他因为面临藏毒指控，所以成为FBI安插在托尼身边的眼线。
案子悬而未决，克拉多暂时出狱，尽管处于家中滞留期，他仍然对侄子满怀嫉恨，让托尼内忧外困，尽管此时他并不知道大猫的事。
Massarone兄弟建筑公司的黑人工人闹罢工，托尼与抗议工人的头儿达成协议，问题得到圆满解决。丽维亚相信，自己的两个长子女准备谋害自己。安东尼告诉她，他偷听到托尼和帕华蒂商量她的“DNR”，更加证实了她的想法。
“大猫”波潘西亚诺向斯基普撒谎说，自从他回到本地还没有见过托尼。
第十六集：
坐了十年牢之后，杰克-亚普里尔的哥哥里奇-阿普勒回到城里，好勇斗狠的他认为可以轻易夺回自己昔日的江湖地位，而现在的情况已与十年前大不相同，老大托尼根本不与任何人直接谈生意，有事只能和希尔维奥或者保里说，里奇非常看不惯，去找旧日同伴、匹萨店老板Beansie
Gaeta，要收取保护费。Gaeta不买帐，结果在餐馆外的巷子中被车子故意辗轧致死。里奇瞒着托尼，偷偷去见了克拉多，打算与他结盟对付托尼。
梅德在丽维亚的家里开派对，把屋子弄得乱七八糟，自己也喝得大醉酩酊。托尼和卡梅拉不知道拿她怎么办，经过商量，他们决定不亲自出面教训女儿，而是假手于帕华蒂，因为她没有青春期的子女，而且是育儿方面的专家。
第十七集：
为开拓新的生意，托尼带着保里和克里斯托弗前往意大利的那不勒斯，与维托利奥家族的老大Zi Vittorio会面，商谈豪华轿车的“出口”业务。卡梅拉则留在家中。
托尼一行人抵达，见到了坐着轮椅的Zi Vittorio，才发现维托利奥家族实际上掌握在他的女儿安娜莉莎手里。她性格粗暴，托尼很难接受她作为家族老大。但是他对意大利家族成员的凶狠和忠诚颇为赞赏，于是与安娜莉莎达成协议，愿以降低汽车价格为交换，要她最得力的属下去新泽西为他工作。弗里奥-吉努塔因此成为瑟普拉诺家族的新成员。
与此同时，安吉告诉卡梅拉自己想与大猫离婚，因为他回来后一直心不在蔫，心事重重。卡梅拉极力劝说她打消离婚的念头，因为婚姻是一种圣礼，一家人不应该分离，不论代价是什么。
第十八集：
弗里奥安全来到美国，他的新身份是阿蒂-博考的Nuovo Vesuvio餐馆雇佣的莫泽雷勒干酪师，其实真正听命于托尼的指挥。
弗里奥来到之后，托尼对组织进行了改革，保里和希尔维奥直接向他请示，下面是弗里奥、克里斯托弗和大猫。对于新安排，保里、希尔维奥和弗里奥都没有意见，但是克里斯托弗和大猫另有想法，心怀不满。
表面看来托尼的组织和生意都一帆风顺，但是在家里他仍然难以控制情绪，对卡梅拉和孩子们大发脾气。他向赫什-拉布金寻求忠告，得知自己家的重要历史，他的父亲约翰尼-鲍伊也有心理疾病，有时严重到会失去知觉。詹妮弗医生给托尼打电话，表示愿意继续为他治疗。
第十九集：
托尼向詹妮弗讲述了自己对他人莫名其妙的愤慨，但是还没来得及发掘内心，他就要去组织一个“决策游戏”。这是克拉多和约翰尼30多年前开始发起的一种高级扑克游戏，参加的都是最富有最尊贵有地位的人。
原来连偷窥一眼都会被克拉多撵走的托尼，如今成为游戏的庄家。托尼的高中同学达维不顾托尼的警告，坚决要参与游戏，结果欠下他一大笔钱。这时他的另一个债主里奇-阿普勒出现，赌局不欢而散，托尼大为恼火。
达维还不起债，把儿子埃里克的吉普车抵给了托尼，他把车子作为礼物给了女儿，梅德毫不领情。但是埃里克指责托尼为难自己父亲时，她又站在托尼的一边。
贾妮斯挑拨起里奇的怒火，要他对付托尼。
第二十集：
安东尼开母亲的车出了车祸，情绪沮丧的他向父母声称，生活和存在毫无意义，宗教纯属谬论。詹妮弗医生告诉托尼，安东尼的痛苦和焦虑是意识到对自己行为负有责任的典型反应。托尼只想让他重新对上帝和自己充满敬畏，他把这个任务交给了波潘西亚诺。
克里斯托弗恋上美丽的女制片人，想和她去好莱坞发展。托尼要他做出选择，留在新泽西或者离开。同时，波潘西亚诺受到特工斯基普的压力左右为难，要么入狱做苦工，要么背叛托尼。
卡梅拉和托尼在家迎接客人，克里斯托弗在前门台阶上苦想十分钟后做出了自己的决定；在浴室里的“大猫”波潘西亚诺也暗自下定了决心。
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